【2026年最新版】Shopifyとヤマト運輸を連携する方法｜API・CSVの違いとおすすめアプリも紹介

Shopifyでネットショップを運営する際に避けて通れないのが配送業務です。特に日本では、ヤマト運輸を利用しているショップオーナーが多いです。しかし、Shopifyとヤマト運輸のシステムをうまく連携させなければ、注文データの手動入力や伝票作成など、多くの時間と労力がかかってしまいます。

特に「注文が増えるたびに1日に何度もこの作業をやるのが苦痛。出荷に追われて他のクリエイティブな業務が全くできない」といったお悩みを持っている方も多いでしょう。

本記事では、Shopifyとヤマト運輸を連携させる方法について、CSV連携とAPI連携の2つの方法を詳しく解説します。また、連携によるメリットや課題、おすすめアプリもご紹介しますので、ぜひ参考にしてください。

Shopifyの送料設定なら「配送カスタム.amp」アプリがおすすめ

Shopifyストアとヤマト運輸を連携させるには、外部アプリの利用が効果的

Shopifyで注文した商品は、ヤマトの送り状（B2クラウド等）に正確にデータを入れなければなりません。Shopifyとヤマト運輸を連携させる場合、CSVやAPIによる手動設定よりも、外部の専用アプリを利用する方法が効率的です。アプリストアでインストールし、設定を行うだけで、配達に関わる業務の手間を簡単に削減できるためです。

• 設定がシンプル：複雑な初期設定も、直感的な操作で簡単に行えます。
• データ形式の自動調整：異なる住所形式や項目の整合性も、アプリ側で自動的に変換・補正されます。
• 日本特有の配送要件に対応：時間帯指定や宅配ボックス指定など、日本市場に特有の配送オプションにも対応しています。
• 継続的なアップデート：Shopifyやヤマト運輸の仕様変更にも、アプリが随時対応するため、安心して運用できます。
• サポート体制の充実：万が一のトラブル時にも、アプリ提供元からの技術サポートを受けることが可能です。

2026年現在、信頼性の高いヤマト運輸連携アプリが複数登場しており、導入も容易です。そこで次章では、おすすめのアプリを紹介します。

Shopifyとヤマト運輸を連携できるおすすめアプリ5選

Shopifyとヤマト運輸（ヤマトB2クラウド）の連携に役立つアプリは数多く存在しますが、その中でも特におすすめの5つのアプリを紹介します。それぞれ特徴や料金プランが異なるため、自分のショップの規模や予算に合わせて選んでみてください。

配送カスタム.amp

「配送カスタム.amp」は、配送地域・発送方法・注文量など様々な条件に応じて配送料金を自由に設定できる国産のShopifyアプリです。配送料の設定において細かなカスタマイズを行いたいストアや、特定の地域や発送方法に対応したいストアにおすすめです。

【主な機能・特徴】

• 細かい配送料設定｜自社ストアの運営状況に合わせた細かい配送料設定が可能
• 日本特有の配送システムに対応｜クール便や代引きなど
• 離島などの地域別配送料金設定｜都道府県や郵便番号ごとに配送料金の設定
• 商品タグごとの配送料金設定｜クール便や小型郵便対象など
• 金額・重量別の配送料設定｜注文の合計金額や合計重量に応じて、柔軟に配送料を自動計算・設定可能。
• 置き配対応｜カンガルー置き配便の設定
• 複合条件での配送料金設定｜複数の配送料金設定条件を加味した配送料金設定
• 配送料金シミュレーター｜配送料金シミュレーターを使用して、設定した条件が意図通り機能するか確認可能

【事例】

クリーニング業界で使用される洗剤や機会の提供を行っている「株式会社光栄産業」では、一般家庭向けの洗剤販売サービス「DAILY CLEANERS & CO-」において「配送カスタム.amp」内の機能である「カンガルー置き配便 by LOCCO」を導入しました。置き配を活用し、再配達を減らしトラックからのCO2排出量削減に取り組んでいる事例です。

参照：光栄産業、脱炭素社会に向けて「宅配便の再配達削減」を目指す

【どのような方に向いているか】
・クール便・代引き・置き配など日本特有の配送形態を採用している方
・商品ジャンルごとに異なる送料設定をしたい方（例：食品と雑貨で送料条件を分けたい）
・離島や特別地域に柔軟に対応したい方

価格（14日間の無料体験あり）

NORMAL	ADVANCED
$12/月	$24/月
基本機能（都道府県、郵便番号、注文合計金額・重量・個数）による送料計算小型郵便、クール便など商品タグごとの配送料金の設定代引きカンガルー置き配便の配送料金の設定複数の配送料金の設定条件を加味した配送料金シミュレーター	NORMALプランの機能全てヤマト運輸 コンビニ受け取りの配送料金設定上記の条件を組み合わせた複合条件の設定【β版】

配送日時指定.amp

「配送日時指定.amp」は、日本の主要な配送業者に合わせて、購入者が商品購入時に配送日や配送時間帯を指定可能にするアプリです。配送日時指定ができるShopifyアプリの中でも人気の高いアプリで、日本での累計インストール数は10,000件を超えています。日本の配送業者に合わせた配送日時指定ができる機能を導入したいストアや、配送スケジュールのカスタマイズを行いたいストアにおすすめです。

詳しく知りたい方はこちらの記事を御覧ください。

【主な機能・特徴】

・配送日時の詳細設定｜配送会社ごとの時間帯、最短・最長日、当日締め切りなどの柔軟な日時制御
・出荷不可日・配送指定不可日・長期休暇の反映｜ストアの営業日に応じて、出荷不可日や配送指定不可日を自動で調整
・条件に応じた配送指定制御｜商品タグやカート内容による配送日時指定の可否や非表示設定
・置き配の受付｜購入時に置き配希望を受け付け、注文情報にも自動反映
・商品単位での配送設定｜特定商品ごとに配送希望日を個別に制御可能
・伝票出力＆追跡番号連携｜CSVやAPIで伝票出力、追跡番号の自動記載に対応
・外部ツール連携｜AnyLogi、定期購買、CRM PLUSなど多数のアプリ・物流ツールと連携

【事例】

配送日時指定.ampは国内外で20店舗以上展開する人気らーめん店「AFURI」で導入されています。AFURIが展開する商品の中には、受注生産の商品もあり、その場合は「配送日時指定モジュールの非表示設定」機能を利用し、配送日時を指定できないようにしています。柔軟性高く、商品ごとに切り分けて配送日時指定の有無を選択できるよう設計されています。

参照：配送日時指定.amp導入事例：AFURI株式会社｜オンライン販売のオペレーションの効率化を実現

【どのような方に向いているか】
・日本の配送会社に対応した細かい配送日時設定を行いたい方
・置き配や特定商品の配送条件を柔軟に制御したい方
・ストアの休業日や長期休暇に合わせて配送設定を自動化したい方

【価格】（14日間の無料体験あり）

NORMAL	ADVANCED
$9.80/月	$19.80/月

購入者が配送日や配送時間帯を指定できるようにしたい方は

配送マネージャー

「配送マネージャー」は、日本の主要な配送会社3社（ヤマト運輸・佐川急便・日本郵便）の送り状CSV出力と、配送日時指定を定額でまとめて導入できる日本製の配送管理アプリです。ネクストエンジンやB2B、国内の商習慣に合わせた細かい出荷ルール設定に対応しており、日々の発送業務を劇的に効率化します。

【主な機能・特徴】

• 送り状CSVの一括出力｜ヤマト運輸（B2クラウド）、佐川急便（e飛伝）、日本郵便（Webゆうパックプリント・クリックポスト等）のフォーマットに合わせた配送伝票用CSVを出力制限なしで発行できる
• 高機能な日時指定カレンダー｜カートページに最短お届け日や配送時間帯を指定できるフォームを設置可能で、ストア独自の休日スケジュールも反映できる
• 追跡番号の自動一括通知｜各配送会社から発行された追跡番号を一括でShopifyに読み込ませることで、発送完了メールの自動送信やLINEへの通知をスムーズに行える
• 柔軟な出力条件ルール｜注文内容（常温・冷蔵・冷凍などのクール便設定など）に応じた出力フィルタリングが可能である

【どのような方に向いているか】

• ヤマト・佐川・郵便をメインに利用しており、手作業での送り状発行から脱却したい方
• カート画面に、ストアの営業日と連動した正確な「お届け日時指定」を導入したい方
• 定額でCSV出力数が無制限、かつシンプルなUIと日本語サポートを重視する方

【価格】 （30日間の無料体験あり）

プラン名	有料プラン（一律）
月額料金	$9.90
主な内容	30日間の無料体験あり。すべてのCSV出力、日時指定、追跡番号通知機能が無制限で利用可能。

Ship&co

「Ship&co」は、国内外の配送業者とシームレスに連携し、送り状の発行や追跡番号の自動管理を可能にするShopify向けの出荷管理アプリです。ヤマト運輸・佐川急便・日本郵便などの国内宅配大手に加え、DHL・FedEx・UPS・国際郵便といった海外向けの送り状発行にも対応しており、国内出荷・海外出荷の両方を一画面で管理できます。

このアプリでできること

• 複数の配送業者とAPI連携し、注文ごとに最適な配送サービスを選択して送り状を発行
• 海外向け出荷の場合は、通関用のインボイスも自動生成
• 送り状の一括発行にも対応し、大量出荷時の業務効率化を実現
• 送り状発行後、追跡番号をShopifyの注文ページへ自動反映してステータスを更新
• 注文タグの同期、代金引換送り状の発行、ギフト依頼主の送り状への記載にも対応

価格（30日間の無料体験あり）

従量課金制（ラベルごとの料金＋インフラ料金）

※ひと月の送り状発行件数に応じて、規定の料金が自動的に適用されます。詳細はこちら。

plus shipping

「プラスシッピング」は、月額固定費無料で国内3大配送会社（ヤマト運輸・日本郵便・佐川急便）の特別運賃を利用できる配送一元管理アプリです。アプリを導入するだけで、個別契約なしで最初から通常よりも安価な特別料金での荷物発送が可能になります。

【主な機能・特徴】

• 大口特別運賃の適用｜個別契約がなくても、導入直後からヤマト・佐川・郵便を公示価格よりお得な事業者限定ルート価格（例: 60サイズ最安499円〜）で利用できる
• 完全シームレスな自動連携｜Shopifyの注文情報が自動で取り込まれるため、手動でのCSVデータ移行をせずとも管理画面上でそのまま送り状を発行・印刷可能
• 多様な配送方法と集荷対応｜常温だけでなく冷蔵・冷凍（クール便）配送に対応し、集荷依頼または配送窓口への持込を管理画面から選択できる
• 追跡番号の即時反映｜ラベル発行と同時に配送追跡番号が注文データへ紐付き、購入者への発送完了メールの送信まで一連の動作が自動化される

【どのような方に向いているか】

• 配送会社との個別運賃交渉が難しい小〜中規模ストアで、1個目から配送料金を抑えたい方
• CSVのダウンロードや他社システムへのアップロード作業を無くし、Shopify画面内で送り状発行を完結させたい方
• 初期費用や月額システム利用料をかけずに、使った分の配送料だけで配送システムを導入したい方

【価格】

初期費用・月額料金	主な内容
無料	システムの利用料は完全無料

Shopifyとヤマト運輸を連携する方法【CSV編】

アプリ以外でヤマト運輸と連携するには、CSVやAPIを活用する方法があります。

CSV連携は、ShopifyとヤマトB2クラウドなどのシステムの間でCSVファイルをエクスポート・インポートすることで情報をやりとりする方法です。

手順は以下の通りです。

• Shopifyの「注文管理」からCSVをダウンロード
• ヤマト運輸の【B2クラウド】にログイン（別途申請が必要）
• Shopify用に整えたCSVをインポート
• 送り状を出力 → 発送
• 追跡番号を手動でShopifyに貼り付け（またはCSVで逆インポート）

CSVの活用方法について、詳しくは下記をご覧ください。

Shopifyストアとヤマト運輸を連携させる方法【CSV編】

ここでは、CSVを使用してShopifyストアとヤマトを連携させる方法、またメリット・デメリットについて紹介します。

CSV連携のメリット

CSV連携のメリットでは、以下が挙げられます。

導入が簡単で設定のハードルが低い

CSV連携の最大のメリットは、特別な技術知識がなくても導入できる点です。Shopifyの管理画面から注文データをCSV形式でエクスポートし、そのファイルをヤマト運輸のB2クラウドなどにインポートするだけで連携が可能です。プログラミングやAPI設定などの専門知識は必要ありません。

導入コストがかからない

CSV連携は基本的に無料で行えます。Shopifyの標準機能でCSVエクスポートが可能で、ヤマト運輸側もCSVインポート機能を提供しているため、追加の費用は発生しません。特に小規模なショップや月間注文数が少ないショップにとっては、コスト面で大きなメリットとなります。

Shopify初心者でも扱いやすい

ECサイト運営初心者やShopify初心者でも、CSV連携なら比較的簡単に操作できます。複雑な設定がなく、エクスポートからインポートという単純な流れで作業できるため、学習コストが低いのが特徴です。2025年のShopifyではCSVエクスポート機能がさらに使いやすくなり、より直感的な操作が可能になっています。

CSV連携のデメリット

一方で、CSV連携には以下のようなデメリットもあります。

毎回ファイルをエクスポート・インポートする手間がある

CSV連携の最大のデメリットは、毎回手動でファイルをエクスポート・インポートする必要がある点です。注文が入るたびに、または1日に何度もこの作業を繰り返す必要があり、注文数が増えるにつれて作業負担も増加します。

ヒューマンエラーが起きやすい

手動での操作が多いため、間違ったファイルをインポートしたり、データの一部を誤って変更してしまったりするリスクがあります。特に忙しい時期には、ヒューマンエラーのリスクが高まります。

処理のスピードや効率には限界がある

CSV連携は基本的に手動作業のため、処理スピードには限界があります。注文数が多い場合、CSV処理だけで数時間を要することもあるでしょう。また、リアルタイム性に欠けるため、顧客への配送状況の即時反映などができません。

Shopifyとヤマト運輸を連携する方法【API連携編】

API連携は、ShopifyとヤマトB2クラウドのシステム同士が直接データをやりとりする方法です。手動での操作を大幅に削減し、自動化レベルを高めることができます。

手順としては以下のとおりです。

• Shopifyアプリストアで任意の連携アプリをインストール
• ヤマト運輸の「発店コード」「顧客コード」などを登録
• ShopifyとAPI接続 → 受注データが自動同期
• 自動で送り状発行・追跡番号の反映

API連携のメリット

API連携には、以下がメリットとして挙げられます。

伝票発行や配送管理が完全に自動化される

API連携の最大のメリットは、注文データの転送から伝票発行までの一連の流れを自動化できる点です。Shopifyで受注が発生すると、そのデータが自動的にヤマト運輸のシステムに送信され、伝票が発行されます。人の手を介することなく処理が完了するため、業務効率が飛躍的に向上します。

作業スピードが向上し、業務負担が激減

手動でのCSVエクスポート・インポートが不要になるため、作業時間が大幅に短縮されます。特に注文数が多いショップでは、この時間短縮効果は絶大です。2025年時点では、AIによる最適配送ルート提案なども一部のAPI連携アプリで利用可能になっており、さらなる効率化が実現しています。

顧客にも追跡情報が即反映されるため、UX向上に直結

API連携では、配送状況がリアルタイムで更新されるため、顧客は常に最新の配送状況を確認できます。「商品がいつ届くのか」という顧客の最大の関心事に対して、正確な情報を提供できるようになるため、顧客が安心してストアで買い物ができます。

API連携のデメリット

API連携のデメリットとしては、以下が挙げられます。

初期設定がやや複雑で技術的な知識が必要なことも

API連携は、初期設定に技術的な知識が必要な場合があります。APIキーの取得や設定、認証情報の入力など、専門的な操作が必要になることもあるため、IT知識のないショップオーナーにとってはハードルが高く感じられることがあります。

一部の連携アプリは有料（月額制）

多くのAPI連携は専用アプリを介して行われますが、これらのアプリは有料のことが多いです。月額数千円～数万円のコストがかかるため、小規模ショップでは費用対効果を検討する必要があります。

アプリやサービス選定に注意が必要

市場には多くのAPI連携アプリが存在しますが、すべてが同じ品質やサポートレベルを提供しているわけではありません。信頼性の低いアプリを選んでしまうと、連携エラーや不具合に悩まされる可能性があります。

Shopifyとヤマト運輸の連携で得られる主なメリット

ShopifyとヤマトB2クラウドを連携させること自体にはどのようなメリットがあるのでしょうか。ここでは、連携によって得られる主な効果を解説します。

作業時間の短縮とヒューマンエラーの削減

ShopifyとヤマトB2クラウドを連携させることで、手作業による注文データの転記や伝票作成が不要になります。特にAPI連携の場合、この効果は顕著です。作業時間の短縮だけでなく、人的ミスによる誤配送などのリスクも大幅に減少します。

配送体験の向上（UX改善）

連携により、顧客は自分の注文した商品の配送状況をリアルタイムで確認できるようになります。「いつ届くのか分からない」という不安を解消できます。顧客満足度を高めることができます。特に即日配送などがAmazonといった巨大マーケットで当たり前になりつつあるため、配送体験の質は購入意思決定に大きく影響します。

最短到着予定の提示で、購入率アップにも貢献

正確な配送日時の提示は、カート放棄率の低下にも貢献します。「明日着」「翌日配送可能」などの情報を正確に表示できることで、購入を迷っている顧客の背中を押す効果があります。

実際に、Baymard Institute社による「46 Cart Abandonment Rate Statistics｜Baymard Institute」によると、「「配達が遅すぎた」という理由で21%もの人が離脱していることも分かっています。そのため、最短到着日ではなくとも、配達日時がどのくらいになるかを明示するのは必須といえるでしょう。

Shopifyとヤマト運輸の連携での主な課題

ShopifyとヤマトB2クラウドの連携には、いくつかの課題も存在します。

まず、ShopifyとヤマトB2クラウドでは住所やデータフォーマットに違いがあるため、そのままでは正確なデータ連携ができないことがあります。

また、Shopifyは海外発のプラットフォームのため、日本固有の配送事情（時間指定や宅配ボックス指定など）に対応していない部分があります。

これらの課題を解決するためには、専用の連携アプリを利用するのが最も効率的です。連携アプリは、ShopifyとヤマトB2クラウドの「橋渡し役」として、データ形式の変換や日本固有の配送設定に対応してくれます。

CSVとAPIを使用するよりも、外部アプリを利用するのがおすすめ

CSVとAPIを使用するよりも、外部アプリを利用するのが、結論としてはおすすめです。外部アプリではCSVやAPIを併用した上手なやり方がスムーズに活用でき、かつアプリストアから無料・有料問わずインストールできるためです。

Shopifyとヤマト連携時の注意点

ShopifyとヤマトB2クラウドの連携をスムーズに行うためには、いくつかの注意点があります。トラブルを未然に防ぐために、以下のポイントに注意しましょう。

他アプリとの競合・干渉がないかチェックする

Shopifyストアには複数のアプリをインストールすることができますが、配送関連のアプリ同士が競合して正常に動作しないケースがあります。特に、別の配送アプリや送料計算アプリがインストールされている場合は注意が必要です。連携アプリをインストールする前に、既存アプリとの相性をチェックするか、アプリ提供元に確認することをおすすめします。

サポート体制・日本語対応の有無も大事

連携アプリを選ぶ際は、サポート体制も重要な判断材料です。日本語サポートが充実しているか、問題発生時の対応スピードはどうか、などを事前に確認しておくと安心です。特に、ShopifyのアップデートやヤマトB2クラウドの仕様変更があった際に、迅速にアプリも更新されるかどうかは重要なポイントです。

2026年現在、日本語サポートが充実しているアプリとしては「配送日時指定.amp」、「配送カスタム.amp」と「配送マネージャー」が特に評価が高いといえます。両アプリとも日本人スタッフによるサポートが受けられ、チャットやメールでの問い合わせに迅速に対応しています。

まとめ｜Shopifyとヤマト運輸の連携で業務がラクに

Shopifyとヤマト運輸の連携は、ECサイト運営の効率化に大きく貢献します。小規模ショップであればCSV連携からスタートし、注文数が増えてきたらAPI連携へ移行するのが一般的です。特に専用の連携アプリを活用することで、技術的な知識がなくても簡単に連携を実現できます。

2025年のECトレンドとして、配送体験の質がますます重要視されています。正確な配送日時の表示や、リアルタイムの配送状況更新など、顧客の「知りたい」という欲求に応えることで、リピート率の向上にもつながります。

本記事で紹介したアプリはいずれも信頼性が高く、日本のEC事情に対応しています。自分のショップの規模や予算、必要な機能を考慮して、最適なアプリを選んでください。Shopifyとヤマト運輸の連携で業務効率化を実現し、本来注力すべき商品開発やマーケティングにより多くの時間を割けるようになるでしょう。

Shopifyの送料設定なら「配送料カスタム.amp」アプリがおすすめ

日本全国のお客様に合わせた送料設定を簡単に実現
Shopifyアプリ「配送料カスタム.amp」を使えば、より柔軟な条件での送料設定を実現します。
・エリアごとの送料設定(都道府県単位 / 郵便番号単位 / 離島)
・小型便・クール便など配送種別ごとの送料設定(商品タグ)
・カンガルー置き配便や代引き配送の送料設定

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